村后原有一座赤山头，山形似马鞍，“鞍”与“垵”谐音，故取名“后垵”。宋末元初，延陵吴氏平庵公从兴化平海卫（莆田）迁居仙境，再迁靖山（松茂），暂居于“戴厝埕”，最后卜居后垵赤山头边。“赤”即是“金”之意，故改为“金山”、又称“金峰”，成为后垵的雅称。民国《台湾彰化吴氏金山衍派族谱》记载：“第一世始祖，肇居泉州府晋江县南关外二十四都龟湖后垵乡，地号金山，即金峰也。” 明代，因赤山头被吴氏视为家族风水山，按其山形，想象为玄龟，故后垵亦称为“龟山”。明末，后垵吴必达重修族谱，工部尚书林朝栋撰写《吴氏谱序》。称：“兹有龟山吴生必达以重修谱集，首举其事，请序于余。”林朝栋还以龟湖塘、天马山、赤山头等形胜赋诗一首以贺： 　突兀双峰下，流光十里湖。 　元龟拱北极，月马跃南都。 　万石关家世，千枝汇图谱。 　簪缨应不息，眼底识全吴。 清初，后垵吴氏东二房登缙公（1648—1724年），名弼，字伯绅，因条陈平海方略，得到总督姚启圣的器重。台湾平定后，吴弼入台求学，成为台湾凤山县“开台第一科岁进士（贡生）”，任福建松溪县儒学训导，参与编修《台湾府志》。吴弼第三子吴东龙定居彰化，为纪念祖籍来自“金山”，自称“金山溯源台瀛衍派”。 后头　位于后垵附近的一个古村落，以位于龟湖鳌头之后而得名，又称“厚头”，记载于道光《晋江县志·铺递志》。 元代，曾氏聚居于此。清代《铺锦新厝黄氏旧谱》记载，铺锦三世祖黄君弼，卒于元至正二十六年（1366年），“葬本都（二十四都）厚头村凤峰山”。 后头曾氏至清代乾隆年间尚见于文献记载。清代《铺锦新厝黄氏旧谱》称，黄植北，字哲纯，生于乾隆二十七年（1762年），“娶后头曾氏”。 据说，民国年间，因为后头人口较少，耕地有限，某年遭遇瘟疫流行，村民患病死亡者甚多。幸存者陆续迁居到附近的山雅、后垵和蚶江锦里等地谋生，后头村落逐渐废弃，原有地界由后垵管辖。（李国宏） 还有3个地名与后垵村同名：福建厦门集美区后溪镇后垵村福建泉州南安市仑苍镇后垵村福建厦门翔安区内厝镇后垵村